現在ＪＡ厚生連は３３都道府県で組織され、そのうち２１道県のＪＡ厚生連が病院を持ち、医療、保健、福祉事業を中心に行い、病院を持たないＪＡ厚生連が１２都県ありますが、それらの都県のＪＡは、健康管理や介護関連事業を展開しています。
ＪＡ新潟厚生連は、地域医療に貢献し、地域のみなさまの健康で心豊かな暮らしを築くため、医療施設１６、老健施設６、看護専門学校２、健診センター他の施設を備えています。多くの皆様から愛され、信頼される医療施設としていっそう努力していきます。
| 糸魚川総合病院 | けいなん総合病院 | 上越総合病院 |
| 柏崎総合医療センター | 中条病院 | 中条第二病院 |
| 魚沼病院 | 長岡中央綜合病院 | 三条総合病院 |
| 新潟医療センター | 豊栄病院 | 水原郷病院 |
| 村上総合病院 | 瀬波病院 | 佐渡総合病院 |
| 真野みずほ病院 | 羽茂病院 |
| 栃尾郷診療所 | 岩沢診療所 | 岩首診療所 |
| 岩首出張診療所 | 水津診療所 | 佐渡市赤泊診療所 |
| 佐渡市松ヶ崎診療所 | 小木出張診療所 |
| 糸魚川総合病院 | けいなん総合病院 | 上越総合病院 |
| 柏崎総合医療センター | 中条病院 | 魚沼病院 |
| 長岡中央綜合病院 | 栃尾郷診療所 | 三条総合病院 |
| 新潟医療センター | 豊栄病院 | 村上総合病院 |
| 佐渡総合病院 |
| 糸魚川総合病院 | けいなん総合病院 | 中条病院 |
| 魚沼病院 | 長岡中央綜合病院 | 栃尾郷診療所 |
| 豊栄病院 | 村上総合病院 |
| なでしこ | |
| はねうまの里 | |
| アルカディア上越（H22.7.1開設） | |
| きたはら | |
| とちお | |
| こばり園 | |
| さど |
| リンクinひだまり |
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| 中央健診センター |
| 新潟健診センター |
| 村上健診センター |
| 中央看護専門学校 | |
| 佐渡看護専門学校 |
